Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms