Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Rab5aQ9CQD1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rab5aQ9CQD1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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