Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpa3Q9CQ71 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms