Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg3Q9CPX6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms