Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms