Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup155Q99P88 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms