Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrrtQ99MR6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms