Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hps4Q99KG7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms