Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp11Q99K46 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp11Q99K46 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms