Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ifitm2Q99J93 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms