Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms