Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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