Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Slc8b1Q925Q3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms