Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Med28Q920D3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms