Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Nek8Q91ZR4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms