Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms