Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms