Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrit1Q8K099 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrit1Q8K099 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms