Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Znf628Q8CJ78 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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