Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LgsnQ8CIX8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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