Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx8Q8CFD4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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