Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc9Q8CDN9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms