Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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