Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms