Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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