Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms