Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtpaQ8BWP5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtpaQ8BWP5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TtpaQ8BWP5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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TtpaQ8BWP5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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TtpaQ8BWP5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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TtpaQ8BWP5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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TtpaQ8BWP5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtpaQ8BWP5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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