Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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