Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc30Q8BVF4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms