Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc2Q8BKV1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gpc2Q8BKV1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gpc2Q8BKV1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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