Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Atg4bQ8BGE6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg4bQ8BGE6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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