Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htatsf1Q8BGC0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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