Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Liat1Q810M6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms