Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ssxb10Q6XAR7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb10Q6XAR7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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