Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd4Q6PDQ2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms