Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp49Q6P9L4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp49Q6P9L4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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