Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Atg16l2Q6KAU8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg16l2Q6KAU8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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