Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sohlh1Q6IUP1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms