Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9aQ68FE2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9aQ68FE2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atg9aQ68FE2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg9aQ68FE2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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