Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja3Q64448 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja3Q64448 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja3Q64448 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja3Q64448 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gja3Q64448 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gja3Q64448 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gja3Q64448 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gja3Q64448 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gja3Q64448 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gja3Q64448 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gja3Q64448 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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