Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5dQ62240 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5dQ62240 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms