Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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