Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lrrn1Q61809 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Lrrn1Q61809 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Lrrn1Q61809 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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