Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms