Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Cln3Q61124 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cln3Q61124 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cln3Q61124 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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