Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms