Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms