Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf3Q60765 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms