Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms