Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprnQ60673 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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PtprnQ60673 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprnQ60673 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprnQ60673 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms